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免疫低下可分为原发性免疫缺陷(Primary immuno—deficiencies)和获得性免疫缺陷(Acquiredimmuno—deficiencies)。免疫系统缺陷或源于胚胎时期的异常，或由于酶系统异常，(如慢性肉芽肿性疾病)；或由于其他未知因素。从上可以看出，免疫缺陷时可出现各类病原体感染，重度免疫缺陷者可同时出现数种病原体，如：军团菌和肺孢子虫肺炎。实验诊断学应按临床检查的规范采取经济而有效的方法明确其诊断并及时予以合理的治疗。本文对肺孢子虫肺炎和细菌感染的病例分别进行讨论。