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缺乏科学的组织管理机制、有效的考核评价和激励机制、合理的利益分配机制及资源流动共享机制,是高校开展协同创新存在的普遍问题。成立多方参与的管理决策机构,专门负责协同创新事务;人才管理柔性务实,以需求导向构建"三维考核"激励评价机制;以公平的利益分配机制保障协同创新中心的持续运行;以"内外兼修"的能力提升策略加强协同创新能力建设,可使高校协同创新走上一条蓬勃发展的道路。