大豆CML家族基因的生物信息学分析

来源 :大豆科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dezhouhaote6600
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CMLs蛋白是一类具有Ca2+结合的EF-hand保守结构域蛋白,广泛参与钙依赖的信号传导途径,在植物生长发育及生物胁迫与非生物胁迫响应中起着重要的作用。通过NCBI和植物基因组注释数据库等筛选并获得了68个大豆GmCML蛋白;分析了所有蛋白的基本特性;通过与拟南芥CMLs基因的进化树分析表明,GmCML家族基因属于8个亚类;对GmCML家族基因进行了染色体定位与重复基因进化关系分析,发现其具有较高的进化速率;序列比对发现GmCML类蛋白含有2~4个保守的EF-hand结构域;利用芯片数据对野生大豆在碱胁迫下的叶和根中的CMLs基因表达模式进行了分析,得到26个GsCML基因在碱胁迫下有显著的差异表达,且在根和叶中的差异表达模式不同,表明这些基因参与植物碱胁迫应答,且具组织表达特异性。 CMLs proteins are a class of Ca2 + -conjugated EF-hand conserved domain proteins that are widely involved in calcium-dependent signaling pathways and play an important role in plant growth and development as well as biotic and abiotic stress responses. Sixty-four soybean GmCML proteins were screened and obtained from NCBI and plant genome annotation databases. The basic characteristics of all proteins were analyzed. The phylogenetic tree analysis of CMLs in Arabidopsis showed that the GmCML family of genes belong to eight subgroups. The results showed that GmCML-like proteins contained 2-4 conserved EF-hand domains. Sequence analysis showed that GmCML-like proteins contained two or four conserved EF-hand domains. Under stress, the expression patterns of CMLs genes in leaves and roots were analyzed, and 26 GsCML genes were significantly differentially expressed under alkaline stress, and the differential expression patterns in roots and leaves were different, indicating that these genes are involved in plant alkali stress Response, and with tissue expression specificity.
其他文献
本文的研究从黄金的双重属性—商品属性和货币属性入手,认为黄金的两种属性虽然在不同的时期表现形式并不相同,但是黄金区别于其他商品的货币属性从来没有也永远不会消失,黄金属
信用风险的管理状况不仅影响着金融主体的经济行为和经营绩效,而且也影响着整个金融市场的秩序和效率.农村商业银行作为我国银行业的重要组成部分,在经济发展中发挥了非常重
本人开设了一家日用杂货店,平常主要经营日用百货、五金、电器等,每年春节还附带销售部分烟花爆竹。今年春节前像往年一样,又批发了一批烟花爆竹准备销售,不料在全县安 I op
关乎岁月,我心中总有一幅画面,那是烟雨柔情的江南,古老的石桥上立着一位温婉女子,手执一把纸伞,似要在细雨朦胧中站成风景,站成永恒。忽而她却娉婷而行,款步而来,衣角被雨丝打湿,洇开一片奇异的花纹。那样真实地走着,叫你看得真切,又是那样虚幻缥缈,叫你抓不住也拦不下……  人不轻狂枉少年  偶然茶余间,提到父亲的孩提时代,母亲脸上带着盈盈笑意,说道:“他呀,也曾是不学无术的顽皮孩子。”  那时的父亲正是
会泽铅锌矿是一个有50年历史的老企业,目前,已形成集采矿、选矿、冶炼、化工,科研为一体的国有大Ⅰ型企业,现年综合生产能力为粗铅2万t、电锌5.5万t、金属锗10t、硫酸6万t;锗
因为经济全球化的影响,英语的地位也变得越来越重要,目前,大多数国家之间的交流都用英语来进行,所以英语的口语能力就变得更加重要。我国的英语教师经过不断地实验和研究,做出了许
陈少平,1961年生,广东省揭阳市人,笔耕丹青四十年不辍,尤其受国画大师齐白石影响甚深,水墨虾趣活灵活现,对国画山水亦颇多探索,尤其是在新岭南画派的继承与创新方面做了诸多
随着锂电池的应用越来越多,对生产的锂电池产品质量提出了更高的要求.与此同时,对锂电池检测系统也提出了更高的要求.本文主要介绍了一种基于单片机控制的锂电池全面综合测试
以2006-2014年间所有A股上市公司为样本,从利益协同和利益侵占效应两方面辩证地分析了大股东控制对投资效率的影响,发现当大股东控制水平较低时,利益协同效应大于利益侵占效
期刊