微阵列定量检测急性白血病患者E—cadherin基因启动子区的甲基化

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目的利用微阵列定量检测急性白血病患者E-cadherin基因启动子区CpG岛的甲基化改变,初步探讨基因芯片在肿瘤甲基化检测中的作用。方法用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,并以此为模板进行PCR扩增。目的序列中未甲基化的CpG位点被翻转成TpG,而甲基化的CpG位点保持不变。设计5组探针构建一种检测急性白血病E-cadherin基因甲基化改变的微阵列。通过绘制标准曲线,定量检测样本的甲基化改变。结果利用微阵列定量检测了5例急性白血病患者的样本E.cadherin基因的甲基化改变,5个检测区域不同程度发生了甲基化,且发生高甲基化的区域一致。检测结果经过基因测序验证。结论基因芯片能够作为一种定量检测基因甲基化改变的有效工具,可用于白血病甲基化的定量研究。其较基因测序省时省力,且能实现定量和高通量检测。

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