【摘 要】
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目的通过癌症基因组图谱(TCGA)和Oncomine数据库深入挖掘膀胱尿路上皮癌发生的关键基因。方法从TCGA数据库中下载膀胱尿路上皮癌RNA测序数据,利用R软件对膀胱尿路上皮癌与癌
【机 构】
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中南大学湘雅医学院附属株洲医院泌尿外科
【基金项目】
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湖南省科技创新计划项目(S2018SFYLJS0466),株洲市科技计划项目(2019-001)
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目的通过癌症基因组图谱(TCGA)和Oncomine数据库深入挖掘膀胱尿路上皮癌发生的关键基因。方法从TCGA数据库中下载膀胱尿路上皮癌RNA测序数据,利用R软件对膀胱尿路上皮癌与癌旁正常组织进行比较,获取差异表达基因,结合用于基因注释、可视化和集成发现的数据库(DAVID)和功能蛋白协作网络(STRING)中的在线生物信息学工具,对差异表达基因进行功能富集分析和调控网络分析,并构建蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络,进一步利用Cytoscape软件中的Cytohubba进行关键(Hub)基因筛选。通过
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