【摘 要】
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利用随机森林-通路分析法,通过袋外样本OOB的分类错误率筛选特征代谢通路,在特征通路上作基因表达相关性研究并对通路上的基因采用MAP(Mining attribute profile)算法挖掘不
【机 构】
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首都医科大学生物信息学实验室与数学教研室
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利用随机森林-通路分析法,通过袋外样本OOB的分类错误率筛选特征代谢通路,在特征通路上作基因表达相关性研究并对通路上的基因采用MAP(Mining attribute profile)算法挖掘不同实验条件下基因的共调控表达模式,对共调控表达模式进行聚类。分析结果显示同一特征代谢通路上的基因表达倾向相似,有2条特征代谢通路存在共表达模式,其中一条通路含108个表达模式,对这些模式进行聚类,其最低聚类的相似系数仍高达0.623,说明同一特征代谢通路上的基因共表达模式在不同实验条件下仍具有高度的相似性。对以通路作为基因模块进行复杂疾病的研究具有借鉴意义。
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