【摘 要】
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运用计算机辅助药物设计寻找黄连抗肿瘤生物碱成分.以“黄连”为关键词,在TCMSP数据库中搜索生物碱类化学成分,从Pubchem数据库下载相应化合物结构;再从蛋白质数据库中下载与
【机 构】
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中南民族大学药学院,武汉职业技术学院生物工程学院
【基金项目】
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国家重点研发计划项目(2017YFC1701004,2018YFC1708004)
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运用计算机辅助药物设计寻找黄连抗肿瘤生物碱成分.以“黄连”为关键词,在TCMSP数据库中搜索生物碱类化学成分,从Pubchem数据库下载相应化合物结构;再从蛋白质数据库中下载与抗肿瘤作用明确的17个靶点蛋白,采用Sybyl软件中蛋白质预处理工具确定活性区域,应用Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score打分函数筛选出活性成分,采用Discovery Studio软件分析结合最好的蛋白复合体的相互作用力.筛选出具有较好结合活性的化合物9个,其中非洲防己碱、巴马亭、N
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