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我国经济飞速发展，我国政府会计制度改革面临新形势与新任务，在实施的过程中会出现各式各样的挑战，其中政府会计制度下科研项目管理中核算与管理建设管理相对滞后出现了一定的问题，但随着相关制度的改革，逐步完善科研项目核算与管理工作，进一步完善政府会计制度体系的建设，为促进经济全球化发展奠定制度基石。本文主要从科研项目系统、固定资产闲置率、科研项目信息几个方面入手分析政府会计制度下科研项目管理中核算与管理建设管理体系建设中影响因素，提出有效解决措施以供参考。