北京市东城区2017-2018监测年度H3N2亚型流感病毒HA1基因进化分析

来源 :中国病毒病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhang1118168
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目的了解北京市东城区2017-2018监测年度H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因序列变异特征及进化情况。方法对北京市东城区2017年4月1日至2018年3月30日采集的流感样病例咽拭子进行核酸检测及病毒分离,将分离得到的12株H3N2亚型流感病毒进行HA1基因序列测定,通过DNAStar 5.0和MEGA 6.0软件与国际卫生组织(WHO)推荐的北半球2017-2018年流感疫苗株、2018-2019年流感疫苗株进行比对,绘制系统进化树。结果以2017-2018年流感疫苗株[A/HongKong/4801/2014(H3N2)-like virus]为参比序列,12株分离株中共发现HA1基因序列中20个氨基酸位点发生改变;涉及到2个抗原决定簇、受体结合位点(RBS)及附近位置。而2018-2019年推荐的疫苗株[A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016(H3N2)-like]氨基酸一些变异位点与12株分离株的氨基酸变异位点一致,差异较小。12株H3N2亚型流感病毒的HA1基因核苷酸同源性为96.35%~100.00%,氨基酸的同源性为94.97%~100.00%,与WHO推荐的2018-2019年疫苗株同源性更高;系统进化树显示,分离到的流感毒株大部分与2018-2019年推荐的疫苗株在一个大分支上,亲缘关系较近,与2017-2018年疫苗株距离较远,差异较大。结论 2017-2018监测年度北京市东城区H3N2亚型流感病毒的HA1基因特性发生了一定改变,与WHO推荐的2018-2019年新疫苗株匹配性更好,将为北京市流感监控发挥更好的保护作用。
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