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目的研究新农合方案调整对参合人住院费用与频次、受益情况的影响。方法分析2005~2012年广州市番禺地区新农合报销补偿的271 113份住院记录,研究不同的个人和政府投入、起付线和报销率的设定、对居民住院费用、基金使用和报销情况的影响。结果较高个人筹资额与补偿比的设定,也伴随了参合人住院费用与频次的上升;较高的区县级、地市级医院起付线,可能会促使参合人在较低起付线的乡镇级医院就医,相关的住院费用较低。结论合理设置新农合筹资水平、起付线及补偿比对新农合合理、平稳运行有重要意义。