基因表达联合甲基化分析探索肝癌肿瘤标志物

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目的通过基因表达联合DNA甲基化分析,寻找潜在的肝癌肿瘤标志物,并验证其临床应用价值。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载原发性肝癌基因表达数据和启动子甲基化数据,并将甲基化谱与基因表达谱进行匹配。筛选出癌与癌旁组织中表达水平有差异的基因和启动子甲基化基因,进一步筛选出低启动子甲基化高表达基因(EI)和高启动子甲基化低表达基因(ES)。将EI和ES基因与人类蛋白互作网络整合,构建EI/ES互作子网,从中挖掘潜在的肝癌肿瘤标志物。利用多个公共数据库资料和组织芯片技术验证其表达差异及预后评估价值。结果
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