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目的
比较草酸钙结石模型大鼠与正常大鼠肾组织小分子RNA(microRNA,miRNA)表达谱的差异,初步分析筛选出的差异miRNA的功能。
方法2015年9-12月,将16只6~8周龄雄性SD大鼠随机分为两组,每组8只。正常组每天自由饮水。造模组使用乙二醇和氯化铵诱导法建立大鼠肾草酸钙结石模型。28 d后应用微阵列芯片筛选正常组和造模组肾组织标本中差异表达(表达量>2倍)的miRNA,对差异表达的miRNA进行靶基因预测,并运用Gene Ontology数据库和KEGG信号通路数据库富集靶基因以初步分析其功能。
结果偏光显微镜下观察肾组织切片,正常组未见草酸钙晶体,造模组可见大量草酸钙晶体。与正常组相比,造模组38个miRNA表达有显著差异,其中上调18个,下调20个;基因本体分析筛选出有显著差异的信使RNA(mRNA)共2 728个,其中上调1 350个,下调1 378个,差异均有统计学意义(P<0.05)。Gene Ontology分析结果显示差异性表达的miRNA与钙离子转运、炎症、损伤、氧化应激、黏附等生物学过程相关。KEGG信号通路分析结果显示这些miRNA参与趋化因子信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用等与炎症反应相关的信号通路。
结论草酸钙结石大鼠与正常大鼠肾组织的miRNA表达谱存在明显差异,这些差异表达的miRNA可能与草酸钙结石形成过程中的钙离子转运、炎症反应、细胞损伤及细胞黏附等相关。