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ＭＨＣ－抗原肽－ＴＣＲ亲和力是影响Ｔ辅助细胞分化的重要因素之一，抗原肽与ＭＨＣ之间亲和力越高越有利于ＴＨ１细胞分化，亲和力越低越有利于ＴＨ２细胞的分化；抗原浓度的变化可以调变抗原递呈细胞表面加工后抗原决定簇的密度；抗原肽－ＭＨＣ复合体与ＴＣＲ之间亲和力越越有利于ＴＨ１细胞分化，反之亦然。ＭＨＣ－抗原肽－ＴＣＲ之间亲和力的不同会导致ＣＤ３ζ链胞内区磷酸化顺序的改变，可能会使亲和力不同的“量变”信号转