【摘 要】
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目的 分析内蒙古牙克石地区莫氏田鼠携带汉坦病毒(HV)的遗传特征及其与汉滩病毒(HTNV)和汉城病毒(SEOV)型HV之间的关系,确定哈巴罗夫斯克病毒(KHAV)的自然宿主.方法 采用RT-PCR检测HV核酸、特异性引物扩增S、M基因并测序及进行序列分析.结果 共捕获52只莫氏田鼠,其中5只为HV核酸阳性,带毒率为9.62％.经PCR扩增,5份HV阳性样本获得全S基因片段,2份阳性样本全M基因片段
【机 构】
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832003新疆石河子大学动物科技学院，中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,832003新疆石河子大学动物科技学院，中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制
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目的 分析内蒙古牙克石地区莫氏田鼠携带汉坦病毒(HV)的遗传特征及其与汉滩病毒(HTNV)和汉城病毒(SEOV)型HV之间的关系,确定哈巴罗夫斯克病毒(KHAV)的自然宿主.方法 采用RT-PCR检测HV核酸、特异性引物扩增S、M基因并测序及进行序列分析.结果 共捕获52只莫氏田鼠,其中5只为HV核酸阳性,带毒率为9.62％.经PCR扩增,5份HV阳性样本获得全S基因片段,2份阳性样本全M基因片段；S基因片段由1848～ 1861 bp组成,M基因片段由3662 bp组成.核苷酸序列同源性分析显示,病毒与KHAV具有高度同源性(S基因片段为92.5％～96.4％,M基因片段为88.9％～95.4％),与其他型HV的差异较大.将核蛋白(NP)和糖蛋白(GP)氨基酸序列与HTNV和SEOV进行比较,NP具有一致的二级结构,GP存在明显的差异.用全S与全M的核苷酸序列构建系统进化树,这些病毒均与KHAV聚集在一起,构成一个独立的分支.KHAV分为2个小分支,核昔酸差异＞5.3％.结论 内蒙古牙克石地区存在KHAV的流行,莫氏田鼠是KHAV的自然宿主。
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