麻风病全基因组关联分析

来源 :中国麻风皮肤病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kaixin314159
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背景: 由于麻风分枝杆菌宿主的局限性和难以在体外培养,限制了对麻风病的研究及其生物学方面的了解.宿主的遗传因素不仅影响对麻风菌的易感性,也影响麻风病的病程.方法: 采用Illumina Human 610-Quad BeadChips对706个麻风病例及1225名正常对照人群进行全基因组扫描,扫描的结果采用PLINK软件进行统计学分析.根据分析结果对可能阳性的93个SNPs位点在3254个麻风病例及5955名正常对照中验证,以确定麻风病的易感基因.同时我们在麻风病的不同临床型别中进行了异质性检验,以期发现与型别相关的易感基因.结果: (1)研究发现位于6个区域的15个SNPs达到了全基因关联研究水平(P<1.0×10-8),定位了6个麻风病的易感基因:HLA-DR,RIPK2,TNFSF15,CCDC122,C13ORF31和NOD2.另外LRRK2基因对应SNP的P值为5.10×10-5,提示该基因可能为麻风病的易感基因.(2)研究发现5个SNPs在多菌型麻风病中的遗传效力强于少菌型.结论: 位于调节固有免疫NOD2介导的信号通路中基因的变异与麻风病的易感性相关.
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