【摘 要】
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对罗氏沼虾肝胰腺组织转录组测序获得的33450条Unigenes,进行简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)检测与分析。结果共检测出15356个SSR位点,分布在12930条Unigenes
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(编号:31570176),国家自然科学基金青年科学基金(编号:31000072).
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对罗氏沼虾肝胰腺组织转录组测序获得的33450条Unigenes,进行简单重复序列(simple sequence repeat,简称SSR)检测与分析。结果共检测出15356个SSR位点,分布在12930条Unigenes上,发生频率为38.65%,平均距离为1.91kb。其中,优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸。SSR序列重复长度主要为12~16bp和18bp,占罗氏沼虾总SSR的86.33%。单核苷酸重复基序中多数为A/T,二核苷酸重复基序以GA/TC、AG/CT及AT/TA为主,三核苷酸重
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