基于改进的自组织神经网络的基因剪切位点的识别

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为提高基因序列中剪切位点的识别率,将无先导卡尔曼滤波器(UKF)和自组织神经网络(SOFM)相结合,给出一种非线性高维数据的聚类算法。利用无先导变换(UT)参数化SOFM邻域宽度函数的均值和方差,并采用UKF进行预测,完成SOFM参数的自适应过程。该算法用于基因剪切位点的识别结果表明:较SOFM与EKF参数自适应方法,该算法识别精度较高,验证了其有效性和可行性。 In order to improve the recognition rate of the cleavage sites in the gene sequence, a non-linear high-dimensional data clustering algorithm is proposed by combining the non-leading Kalman filter (UKF) and the self-organizing neural network (SOFM). The mean and variance of the SOFM neighborhood width function are parameterized using no-lead transformation (UT), and the UKF is used to predict the SOFM parameters. The results of this algorithm for gene-cut site identification show that compared with the SOFM and EKF parameter adaptive methods, the recognition accuracy of the algorithm is high, which verifies its validity and feasibility.
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