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2006年11月和2007年2—9月，对齐云山保护区的鸟类进行了本底调查和物种监测，共记录到鸟类257种，隶属于17目54科。其中留鸟120种，候鸟（夏候鸟、冬候鸟和旅鸟）137种；古北界种类97种（37．7％），东洋界种类141种（54．9％），广布种有19种（7．4％）；国家重点保护鸟类8科34种；发现江西省新纪录鸟类4种。多样性分析结果显示，该区鸟类群落Shannon—Wiener指数、Pielou指数、和Simpson指数分别为3．875、0．791和0．964。从各生境群落多样性指数看，农田居民