二维分子形状和定量手性程度的研究

来源 :计算机与应用化学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:A58400794
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
以二进制编码描述苯环型化合物分子在二维空间的形状,所得到的编码能够区分二维平面上一对苯环型化合物对映体。由于对映体的二进制编码不同,基于化合物和其镜像的编码计算得到了海明距离,并以其表征1对对映体的定量手性程度。以28对周长为22的手性苯环型化合物对映体为实例,计算苯环型化合物的定量手性程度,其结果仅仅有2个数值,分别为海明距离4和6。具有不同形状的该类化合物很多,为了提高分辨率,分别计算了窗口宽度从1~16时的海明距离,并分别以其来代表定量手性程度。结果显示全部16个窗口的海明距离的加和具有最大的区分能力,共得到17种海明距离。如果将每一窗口的细节引入到计算中,并采用类似的方法计算,则实例中所有的28个苯环型化合物实现了完全的区分,所得到的定量手性程度的区分能力是令人满意的。本研究证明如果用适当的编码来描述二维空间中分子的边界,能够解决分子形状的定量表征。尽管本文的二进制编码衍生于平面系统的苯环型化合物,并以其描述分子的边界来进行手性程度的测量,但是,原则上同样的方法可以应用到所有二维平面上的形状描述。 The binary code is used to describe the shape of benzene ring compound molecules in two-dimensional space. The obtained code can distinguish the pair of benzene ring compound enantiomers in the two-dimensional plane. Due to the binary encoding of the enantiomers, the Hamming distance was calculated based on the compound and its image coding and was used to characterize the quantitative chirality of one pair of enantiomers. The quantitative chirality of benzene ring compounds was calculated on 28 enantiomers of the chiral benzene ring compound with a perimeter of 22, and the result was only two numerical values, namely Hamming distance 4 and 6, respectively. There are many kinds of these compounds with different shapes. In order to improve the resolution, the Hamming distances of window widths from 1 to 16 are calculated respectively, and the quantitative chirality degree is represented respectively by them. The results show that the sum of the Hamming distances of all 16 windows has the maximum discrimination ability, and a total of 17 Hamming distances are obtained. If the details of each window were introduced into the calculations and calculated in a similar way, all 28 benzene ring compounds in the example were completely distinguished and the resulting ability to discriminate between quantitative chirality levels was satisfactory of. This study shows that if proper coding is used to describe the boundaries of molecules in two-dimensional space, the quantitative characterization of molecular shapes can be solved. Although the binary code herein derives from benzene ring compounds of planar systems and describes the degree of chirality in terms of the boundaries of the molecules, in principle the same approach can be applied to the shape description on all two-dimensional planes.
其他文献
孤岛油田西区注聚区 1997年 3月投入注聚后 ,高渗层得到有效封堵 ,吸水剖面得到明显改善。注聚期间 ,通过实施注聚区外围水井降水或停注、油井放大生产压差和调整注聚井注入
运用离子选择性电极、调理电路、DAQ卡和计算机,构建基于LabVIEW 8.0的电位法测定振荡反应虚拟仪器系统,实现自动采集振荡反应系统电位的变化,实时绘制振荡曲线,存储处理测量数据,自动报告测量结果。虚拟仪器可多路同步,方便快捷地用电位法研究振荡反应,系统操作简便、人机界面友好,避免人工处理数据的繁琐,提高了测量的准确性和重现性。系统测定B-Z振荡反应结果表明,能实时同步绘制出双振荡曲线,其表观
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
制备苄嘧磺隆的单晶并用X射线衍射测定晶体结构。苄嘧磺隆晶体属于单斜晶系,C2/c空间群。晶胞参数为:a=33.831(7),b=6.902 0(14),c=16.021(3),α=90.00(3)。,β=104.48
出砂已经成为影响油井产能和损害生产设备的严重问题。在油田开发阶段 ,必须认真设计与出砂有关的一些生产参数。利用弹性和弹塑性理论建立了防止油井出砂的临界井底流压计算
>>浙江省老年医学重点实验室rn浙江省老年医学重点实验室依托浙江医院建设,实验室主任由博士生导师、主任医师严静院长担任,主要研究方向是:心脑血管病流行病学和防治技术研
采用Visual Basic 6.0编写了Bi-Cd双金属体系步冷曲线的教学演示程序。程序结合物理化学相关数据,描述了不同条件下Bi-Cd体系的步冷曲线。在程序中,通过调节的金属质量比例和
粒子方法是过程工程领域的重要研究手段.粒子模拟是粒子方法在计算机上的实现.粒子方法具有计算强度大的特点,随着粒子模拟系统规模的扩大,如何在现有计算机硬件设备基础上提
今年下半年,全省科技系统要认真贯彻落实省委十二届七次全会和十一届人大三次会议精神,紧扣建设创新型省份和科技强省目标,围绕“十一五”规划和年初确定的各项目标任务,以实
孤岛油田和孤东油田为疏松砂岩油藏 ,已进入开发后期 ,油水井套管损坏严重。统计了两油田的套管损坏位置分布特点和损坏类型。并从注水、出砂、地层滑移、固井、采油及井下作