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红萍干萍、米糠等按C：N比为25—30进行堆肥发酵，利用微生物分解红萍制作红萍有机肥。红萍发酵过程中温度迅速上升直至最高温度，然后开始下降；此时进行适时翻堆，当翻堆后温度又开始升高，然后再次下降；再次进行翻堆，温度又重复如此变化，但每次变化程度都有所不同，呈现不断加剧现象。pH值则呈不断上升趋势。不同营养成分发生了不同的变化，全N、P、K和速效P、K呈下降然后再上升趋势，速效N呈上升趋势，其含量得到了大大的提高。由此可见采用此方法可以制成优质的红萍有机肥。