【摘 要】
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目的 加深对双歧杆菌中CRISPR-Cas系统结构特征与作用机制的认识,为基于内源性CRISPR-Cas系统构建基因编辑工具提供基础.方法 以实验室保存的39株双歧杆菌为研究对象,找出基
【机 构】
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湖南科技学院湘南优势植物资源综合利用湖南省重点实验室,湖南永州 425199
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目的 加深对双歧杆菌中CRISPR-Cas系统结构特征与作用机制的认识,为基于内源性CRISPR-Cas系统构建基因编辑工具提供基础.方法 以实验室保存的39株双歧杆菌为研究对象,找出基因组中的CRISPR簇与cas基因,并对各分型系统中CRISPR的repeat序列保守性、spacer分布特征和某些Cas蛋白序列进行生物信息学分析.结果 39株双歧杆菌中含CRISPR菌株的比例为61.5％ (24/39),相同分型系统的repeat序列有保守的回文重复序列,Ⅱ型系统的tracrRNA可结合crRNA形成保守的结构,菌株内spacer重复分布发生较常见且类型多样,菌株间Cas1的序列同源性与系统分型相关而与种属无关,Ⅱ-A型与Ⅱ-C型系统的Cas9结构域构成差异明显.结论 双歧杆菌中含CRISPR-Cas系统的菌株的比例较高,CRISPR序列重组比较活跃,在构建可移动基因编辑工具方面双歧杆菌内源性Ⅱ-C型系统具有优势.
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