【摘 要】
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GATA转录因子在植物中广泛存在，并参与生长发育、生物和非生物胁迫等多种生物学过程，为深入阐明GATA基因家族在剑麻相关生物学过程中的重要功能。本研究基于转录组水平鉴定手段
【机 构】
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中国热带农业科学院南亚热带作物研究所; 湛江市热带作物遗传改良重点实验室;
【基金项目】
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现代农业产业技术体系建设专项资金资助(No.CARS-16);中国热带农业科学院南亚热带作物研究所基本科研业务费专项资助(No.1630062019021);湛江市热带作物遗传改良重点实验室建设项目(No. 2015A06005);海南省自然科学基金青年基金项目 (No. 319QN288)共同资助
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GATA转录因子在植物中广泛存在，并参与生长发育、生物和非生物胁迫等多种生物学过程，为深入阐明GATA基因家族在剑麻相关生物学过程中的重要功能。本研究基于转录组水平鉴定手段，对剑麻基因家族进行鉴定分析以及表达模式研究。在前期已完成的RNA-seq数据的上，利用相关软件对剑麻GATA基因家族进行鉴定，同时对得到的剑麻GATA基因家族进行理化性质、保守结构域、进化关系和表达模式分析。在剑麻中共筛选获得23个GATA基因，其编码蛋白质的氨基酸数目在118～581之间，分子量约为12.74～64.87 ku，等电点为5.19～10.22。亚细胞定位预测结果显示18个AhGATAs定位于细胞核，3个AhGATAs定位于叶绿体，2个定位于线粒体。AhGATAs基因家族含有GATA、RPN13＿C、AhXH、CCT 和Tify这五个相对保守的结构域。进化树分析表明剑麻GATA蛋白可分为五个亚家族。23个剑麻GATA基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律。本研究在转录水平上初步完成了剑麻GATA基因家族的鉴定与功能分析，为后续深入解析AhGATAs基因在剑麻中的具体功能提供参考。
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