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海军医学研究所是总后卫生部1992年1月确认的全军首批科技查新单位，命名为《海军医药卫生科技查新站（海军医学研究所）》，并颁发了《军队医药卫生科技查新站资格证书》。海军医学研究所查新站负责全海军和周边其它军种的医药卫生系统的科技查新工作，具体承担申报各类军队科技成果奖、医疗成果奖和各项科研立项、鉴定查新，以及硕士、博士研究生开题查新与检索证明。根据查新内容的不同，大致可分为两类：申报科研立项和申报科技成果奖查新。科研立项查新包括国家自然科学基金项目、国家各类标准项目和新开课题的立项查新。科技成果查新包括各等级的军队科技进步奖、医疗成果奖和成果鉴定以及申报专利等查新。此外，还有为了解决技术攻关和了解市场行情等方面的文献检索与技术咨询服务。