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化学信息处理是一个完整的思维过程，它包含对语言文字、化学符号、术语、模型、图表等等的感知和认识，及新概念的形成和内化，信息材料的理解和记忆等活动。同时，化学信息处理过程又是一个不断假设、猜想、推理、验证、归纳整理这样一种积极能动的认知过程。由于化学语言的符号化、逻辑化和严谨性、抽象性等特点，使得化学信息处理又有不同于一般信息处理的特殊性。