基于转录组的大头金蝇密码子的偏好性分析

来源 :江苏农业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:michellehb1
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  摘要:使用Codon W软件分析大头金蝇[Chrysomya megacephala(Fabricius,1794)]转录组10 923条全长转录序列的密码子偏好性。结果表明,大头金蝇转录组中的AT含量(61.81%)远大于GC含量(38.19%);PR2(parity rule 2,即密码子偏好性)绘图结果显示,密码子第3位碱基A的使用频率大于碱基T,碱基G的使用频率大于碱基C;中性绘图结果显示,该序列密码子的使用更多地受到选择压力的影响;有效密码子数(effective number of codons,简称ENC)在25.17~61.00个之间,均值为43.16个;密码子适应指数(codon adaptation index,简称CAI)在0.099~0.554之间,均值为0.215 8。结果共筛选出29个同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,简称RSCU)
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摘要:研究不同小麦品种的种子萌发期抗旱性,利用100 g/L的PEG-6000作为渗透介质进行室内模拟干旱胁迫,测定了30个小麦品种种子萌发期间贮藏物质转运率、初生根数、主胚根长、芽长、发芽势、萌发指数、发芽率等生理指标。采用主成分分析法将7个单项指标转换为2个新的相互独立的综合指标,用系统聚类分析法和隶属函数法相结合的方法对小麦品种种子萌发期的抗旱性进行综合评价。研究结果表明,30个小麦品种可以
摘要:以徐麦33号为材料,于2017年10月—2018年6月在徐州农业科学研究所试验场内进行冬小麦分期播种试验,播期为10月10日、10月20日、10月30日和11月9日,研究不同播期条件下土壤水分和产量的差异。研究结果,适当推迟播期有利于改善0~30 cm土壤墒情,在小麦生育后期尤为明显,但对30~50 cm土壤墒情无明显影响。推迟播期对小麦叶面积指数和干物质累积均有较为明显的抑制作用,产量随播
摘要:研究不同品种苜蓿在硒溶液处理条件下的发芽特性,比较其耐硒性,为富硒紫花苜蓿的栽植利用提供依据。试验采用水培法,以WL343HQ、WL353LH、WL363HQ、WL903、劲能5010、拉迪诺、甘农5号等7种苜蓿种子为研究对象,设置5个亚硒酸钠梯度,分别为0、8.647、17.294、25.941、34.588 mg/L。试验使用人工培养箱,以滤纸作为发芽床,每个品种3次重复试验,单因素分析
“唉,唉,唉——”面对那满桌子的作业,我不止发出n次叹息。“哎呀,这么多作业,尤其是地理,卷子要抄两遍,看来又要奋战到凌晨了。”我从作业堆里抬起头来,揉了揉蒙眬的双眼,伸了个懒腰,抱怨道。爸妈都已经回房休息了,可总是每过二三十分钟就起来问一句:“作业做完了吗?”这时,我就会狠狠地抓着头发,弱弱地说一声:“还没……”爸妈顿时沉下脸来,心事重重地回到房间。  面对这似小山般的作业,我不知从何处下笔:先
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我时常会梦见一个人。  我们好像在哪见过,是在蔚蓝天空映衬下缓缓敲击七次的钟楼旁,是在“长风破浪会有时,直挂云帆济沧海”的朗朗读书声里,是躲在窗纱后偷偷小憩的睡梦中,还是在迎着太阳冉冉升起的国旗下,抑或是在郑重而虔诚的成人礼的宣誓中。她穿着一身干净的校服,梳着清爽的马尾。我们似曾相识,却又缥缈久远,只留下淡淡的清香萦绕在鼻尖,回味悠长。  我们好像在哪见过,不论是在日日夜夜的奋笔疾书中,还是在挥洒