基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用

来源 :中山大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：allpass001

【摘要】

：

基于unix/linux操作系统和mysql数据库,利用phred/phrap, stackpack, blast软件,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析.它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化,去除载体污

【作者】

：

符志彦卢阳叶兰汀何智良徐安龙

【机构】

：

中山大学生命科学学院

【出处】

：

中山大学学报

【发表日期】

：

2004年期

【关键词】

：

cDNA分析系统大规模测序 unix/linux操作系统 phred/phrap软件 stackpack软件 blast软件

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

基于unix/linux操作系统和mysql数据库,利用phred/phrap, stackpack, blast软件,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析.它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化,去除载体污染和重复序列,序列聚类,拼接,分析可变剪切,数据库搜索进行相似性分析.该系统可以加速大规模EST测序的分析速度.

其他文献

劳动力流动的技术性相关因素探析——基于江苏金湖数据的实证研究

本文利用实地调研数据,采用Logit回归模型对江苏金湖农村劳动力流动技术含量选择情况进行回归分析.分析表明金湖农村劳动力就业的技术性相关因素主要是年龄、性别、文化程度

期刊

农村劳动力劳动力转移技术性选择Logit回归

考虑起落架动力学特性的防滑刹车系统仿真研究

以某型飞机参数作为依据,建立了带有起落架数字模型的飞机防滑刹车系统模型,通过系统仿真及与实际刹车过程对比分析,证明了此系统模型是实用的,较真实的反映出了飞机防滑刹车

期刊

防滑刹车系统仿真起落架

工业以太网在能源计量数据采集方面的应用

介绍了以太网技术在能源计量数据采集方面的应用,并通过实例说明了应用以太网对动力能源计量数据的适时监控是企业为节能降耗进行技术提升的发展方向之一。 This paper intr

期刊

以太网组态王PLC

寻找交接点--盐城师范学院图书情报中心设计

对旧建筑进行改造、加建,使旧建筑与新建筑通过一种创造性的方式结合在一起,具有非常现实的意义和巨大的价值.该文试图通过盐城师范学院图书情报中心的设计探索,讨论在原有校

期刊

改造扭转交接整合

民航英语的文体与语言特征

为了清楚和得体地传达信息,需选用各种各样的文体交流.在航空英语中有许多文体及其语言特征,如飞行员与塔台之间的无线电通话、民航专业书籍、民航法律法规和操作手册.无线电

期刊

语篇文体语言特征词法特征句法特征语义特征

用JAVA设计数据库中立存储模块

应用Java的平台性质并根据SQLJ的定义能够设计适用于不同数据库管理系统的数据库存储模块。

期刊

数据库管理系统ANSI SQL-99数据库中立存储模块

Visual Prolog智能集成开发环境评述

Visual Prolog是国际上已经广泛流行的功能强大的通用智能化应用集成开发环境.本文全面评述其功能特点,包括Visual Prolog的由来与发展、可视化开发环境、可视化编程接口、语

期刊

Visual Prolog人工智能逻辑程序设计开发环境

分析软件在力矩器磁场分析中的应用

介绍分析软件在挠性陀螺仪力矩器磁场分析中的应用,以具体实例较为深入地对其进行了说明.

期刊

分析软件力矩器磁场仿真分析

基于图形识别的剪力墙标注方法

根据剪力墙施工图的特点,提出了基于图形形状识别的剪力墙尺寸标注方法。通过对剪力墙图形特点的分析,在现有图形识别方法的基础上,结合人工智能和模式识别在图形分析中的应用,提出了区域关系的图形识别方法,建立了一个可以不断学习新形状的图形模板库。通过图形间的匹配关系来进行剪力墙尺寸标注,从而大大提高了剪力墙尺寸标注的合理性。

期刊

剪力墙尺寸标注CAD人工智能模式识别

高校图书馆基础工作建设与革新

本文阐述了在高校合并、扩招及图书馆数字化、网络化进程中新的形势下,高校图书馆取得的成效及存在的问题,提出如何加强图书馆基础工作的建议与改革措施.

期刊

高校图书馆基础工作问题革新

基于unix的cDNA序列自动分析系统的构建和应用

与本文相关的学术论文