2009~2010年华东地区猪圆环病毒2型的基因型分析

来源 :江苏农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dannananjing31306111
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为分析2009~2010年中国华东地区猪圆环病毒2型(PCV2)的基因型分布情况,应用可以区分PCV2a和PCV2b的鉴别PCR,对浙江、江苏、安徽、山东、上海、江西等6省市的210份血液和组织样品进行PCV2检测,并选取10份阳性病料进行全长基因组扩增,应用DNAStar软件对获得的10株PCV全长基因和GenBank中的参考毒株进行序列分析和系统进化树分析.结果表明210份病料中107份为PCV2阳性,36份为PCV2a基因型,97份为PCV2b基因型,检出率分别为17.1%和46.2%,两个基因型的共感染率为12.4%.10株分离株的序列分析结果表明,华东地区PCV2流行毒株之间的核苷酸同源性为96.3% ~99.9%,与GenBank其他PCV2参考毒株的同源性为95.0%~99.9%.系统进化树分析表明中国华东地区PCV2存在3种基因型:PCV2a、PCV2b和PCV2c.
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