基于TCGA和LASSO回归的胃癌预后lncRNA预测模型构建

来源 :临床肿瘤学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jxnydxlhy1

【摘要】

：

目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选胃癌预后相关关键长链非编码RNA(lncRNA)并构建预测模型,为判断胃癌患者预后情况提供参考依据。方法下载TCGA数据库中407例胃癌组织

【作者】

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常紫薇刘辉张秋萌李兴雨史旋景丽伟张超

【机构】

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华北理工大学附属医院消化内科,中国人民大学国家发展与战略研究院

【出处】

：

临床肿瘤学杂志

【发表日期】

：

2020年9期

【关键词】

：

胃癌长非编码RNA 癌症基因组图谱最小化绝对收缩和选择算子预后预测模型 Gastric cancerLong non-coding RNAThe Can

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81803106),河北省自然科学基金资助项目(H2020209166),河北省教育厅项目(QN2018227)

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目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选胃癌预后相关关键长链非编码RNA(lncRNA)并构建预测模型,为判断胃癌患者预后情况提供参考依据。方法下载TCGA数据库中407例胃癌组织样本的RNA-Seq数据和443例胃腺癌患者临床及预后资料,对胃癌组织与癌旁组织差异表达lncRNA进行分析,采用Cox比例风险回归模型及最小化绝对收缩和选择算子(LASSO)回归算法构建预测模型并对模型预测的有效性进行验证。采用多因素Cox回归模型分析该预测模型是否为胃癌独立的预后因素。结果纳入的368例胃癌样本中筛选出3

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