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伊通地堑充填白垩系、下第三系、上第三系和第四系碎屑沉积物，厚约２０００～６０００ｍ。地堑内主要发育冲积扇体系、扇三角洲体系和湖泊体系，在地堑不同演化阶段分别构成６种沉积体系域类型．层序地层格架主要受控于构造、物源体系、湖的扩展及萎缩旋回和沉积中心分布。层序地层格架样式显示南北向隆回相间、东缓西陡的不对称式充填特征。