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基于生物信息学的活动性结核生物标志物的筛选

来源 :国际检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：mangshengsun1
【摘 要】
：
目的通过采用生物信息学方法挖掘活动性结核生物标志物,提高活动性结核诊断效率。方法登陆GEO数据库下载基因表达芯片GSE19491、GSE25534和GSE31348。采用在线分析工具GEO2R
【作 者】
：
洪佳 李汛 
【机 构】
：
武汉大学人民医院妇产科,武汉大学人民医院感染科
【出 处】
：
国际检验医学杂志
【发表日期】
：
2020年16期
【关键词】
：
活动性结核 感染 生物信息学 基因芯片 active tuberculosisinfectionbioinformaticsgene chip 
【基金项目】
：
武汉大学青年教师资助项目(2042017kf0112)
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目的通过采用生物信息学方法挖掘活动性结核生物标志物,提高活动性结核诊断效率。方法登陆GEO数据库下载基因表达芯片GSE19491、GSE25534和GSE31348。采用在线分析工具GEO2R对GSE19491和GSE25534两组芯片数据进行分析,筛选活动性结核感染与正常组织或潜伏结核感染(LTBI)之间的差异表达基因,通过取交集获取核心基因。通过Metascape进行核心基因功能分析,并通过STRING 11.0进行核心基因编码蛋白的相互作用分析。提取活动性肺结核患者GSE31348芯片中核心基因的表
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