【摘 要】
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目的采用网络药理学方法和分子对接技术,探讨巴戟天治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制。方法通过TCMSP、GeneCards、OMIM、TTD以及String数据库获得巴戟天活性成分、作用靶点以及RA相关疾病靶点,采用Cytoscape 3.7.1软件绘制"化学成分-靶点-RA"网络图,采用String和DAVID数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(prot
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目的采用网络药理学方法和分子对接技术,探讨巴戟天治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制。方法通过TCMSP、GeneCards、OMIM、TTD以及String数据库获得巴戟天活性成分、作用靶点以及RA相关疾病靶点,采用Cytoscape 3.7.1软件绘制"化学成分-靶点-RA"网络图,采用String和DAVID数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)、基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,使用Chemdraw、PyMOL、AutoDock Tools软件以及RCSB PDB数据库对活性成分与关键靶点进行分子对接。结果共筛选出11个巴戟天活性成分和37个关键靶点,GO功能和KEGG通路富集分析显示巴戟天可能通过信号转导、RNA聚合酶II启动子的转录起始、蛋白质结合、三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)结合等生物学过程,作用于哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,m TOR)、Janus激酶1(Janus kinase1,JAK1)、JAK2、半胱氨酸蛋白酶-1(Caspase-1)、髓样细胞白血病蛋白1(myeloid cell leukemia 1,MCL1)等关键靶点的表达,进一步调控磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路、癌症信号通路、HTLV-1感染等信号通路,从而治疗RA。分子对接结果显示,巴戟天中活性成分与关键靶点间存在分子结合位点。结论巴戟天能够通过多成分、多靶点、多通路、多机制治疗RA。
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