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设计采用蒸汽双效溴化锂吸收式冷水机组作为夏季空调冷源，选用蒸汽-水板式换热机组作为冬季空调热源。空调冷热水采用二次循环泵的变频调速和台数控制。空调采用全空气系统及风机盘管加新风系统，另外对有医疗工艺要求的区域进行相应的压力控制，部分实验室／科室根据工艺要求设独立进排风系统，配置异味吸附器或高效过滤器，废气高空排放。