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本文报告了我国登革Ⅱ型病毒3个分离株（04、05和43株）包膜蛋白基因的核苷酸序列及推断的氨基酸序列。并通过美国MACAW微机程序对3株之间的核苷酸与氨基酸序列进行了比较分析，并分别与其它Ⅱ型毒株进行比较，发现04、05和43株核苷酸序列同源性为95.76%～95.96%，它们之间无明显差别。氨基酸类似性为92.12%～94.30%，氨基酸类似性略低于核苷酸序列同源性。通过变化的核苷酸在三联密码中位置分析及核苷酸换同换异比较分析，发现3个毒珠之间是有差别的，明显地看出05株与其它各毒株变化大于04株和43株；05株前两位密码子变化较多，换异也较多。04、05和43株分别与其它登革Ⅱ型毒株比较，发现它们均与牙买加株（JAM）最为类似，其次是NGC和M3株，与S1株类似性最小。