研究叶酸代谢通路中关键酶单核苷酸多态性(SNPs)与中国北方汉族儿童神经管缺陷(NTDs)的相关性。
方法以中国北方汉族152例NTDs患儿和169例对照者为研究对象进行病例-对照研究。采用Sequenom MassARRAY SNP分型技术对5个基因的16个SNPs位点进行基因分型。应用SIFT和PolyPhen程序预测评价点突变对蛋白质功能的影响。
结果亚甲基四氢叶酸脱氢酶1(MTHFD1)基因rs2236225位点等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义(χ2＝5.292、6.080；P＝ 0.021、0.048)，且A等位基因和AA基因型携带儿童发生NTDs的风险高于G等位基因和GG基因型携带者(OR＝1.500，95%CI 1.061～2.120；OR＝2.862，95%CI 1.022～8.015)。亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因rs1801133位点等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义(χ2＝7.403、6.973；P＝0.007、0.031)，且T等位基因和TT基因型携带儿童发生NTDs的风险高于C等位基因和CC基因型携带者(OR＝1.552，95%CI 1.130～2.131；OR＝2.344，95%CI 1.233～4.457)；甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)基因rs1801394位点等位基因和基因型频率在病例组和对照组中的分布差异具有统计学意义(χ2＝6.365、6.219；P＝ 0.012、0.045)，且G等位基因和GG基因型携带儿童发生NTDs的风险高于A等位基因和AA基因型携带者(OR＝1.553，95%CI 1.102～2.188；OR＝2.355，95%CI 1.044～5.312)。MTHFR基因rs1801133和MTRR基因rs1801394的SIFT预测结果为damaging，PolyPhen预测结果为probably damaging，均提示为有害突变。
结论MTHFD1基因rs2236225、MTHFR基因rs1801133及MTRR基因rs1801394位点多态性与中国北方汉族儿童NTDs发生具有相关性，证实叶酸代谢通路中关键酶基因的变异是NTDs遗传易感性因素之一。