有媒体统计数据显示，近年来曝光的科研经费贪污案件中，高校所占比重较大，科研经费实际用于项目本身仅占大约四成，科研经费流失现象十分严重。许多科研项目负责人借职务之便，钻管理制度及管理方式的空子，开具虚假发票、编制虚假预算、编制虚假账目、编造虚假合同，通过各种非正当手段套取科研经费，使科研项目变成“私人提款机”。
　　对此，有人建议应加大对贪污、挪用科研经费违法者的惩罚力度，使其“不敢”胡作非为。这无疑是必要的，但是，如果仅仅处置违法学者，就等于只治标不治本。若想从根源上杜绝非法套取科研经费的现象，需要科学制定高校科研经费管理制度。在管理上堵住了漏洞，那些学术“硕鼠”才不能有可乘之机。
　　若想完善科研经费管理制度，必须要明确区分开科研经费使用与管理中所涉及的职责和权限，高校科研部门负责科研项目与合同的管理；财务部门负责审核经费使用状况等工作；项目负责人则主要负责编制科研项目经费预算与决算，并对科研经费使用的真实性承担法律责任和经济责任；高校的纪检监察部门应履行监督科研经费使用情况的职责；每个科研项目都要公开资源配置，让科研经费使用情况更加透明。
　　加强科研经费管理制度建设，加大对科研经费管理的力度，能够有效扼制科研经费大量流失。笔者认为，从“大禹治水”故事的角度看，使用管理制度加以控制是“堵”，但历史的经验表明，无论制度多么严密、严谨，总有一些善动歪念头的人会找到并利用制度的缝隙，做出不光彩的事。因此，需要堵的地方必须堵，但同时也应反向考虑一个问题，那就是需要“疏”的时候必须“疏”。“堵”是在管理机制上做文章，可以有效解决“不能”贪占的问题；“疏”则是在奖励机制上下工夫，可以促使人“不想”贪占，在这方面，已经有高校作出了表率。
　　今年夏天，河南科技学院召开科技大会，奖励了国家科技进步一等奖获得者茹振钢教授小麦育种团队260万元。高校以260万元奖金重奖科研功勋，在国内并不多见。河南科技学院此举的初衷，在于调动和激发校内科研工作者的积极性，同时，这种激励措施在客观上也会达到“重奖养廉”的目的。
　　有人可能会混淆“奖金”与“经费”的差别，认为像茹振钢教授所获的260万元不应归个人所有，其实这种认识是偏颇的。因为“奖金”与“经费”在性质上完全不同，奖金是一种酬劳，作为酬劳则不必属于“公有”，完全可以自由支配；经费是科研活动资金，必须专款专用，且不能归个人所有。以往屡屡出现侵吞科研经费的乱象，原因是多方面的，但不容否定的是，对科研功勋的过度忽视是其中一个重要因素。科研人员得不到应有的酬劳，往往会产生心理失衡，为弥补物质上的缺失，就可能会在科研经费上动脑筋、下手脚。
　　“科学技术是第一生产力”，社会的发展与进步有赖于科技的发展与进步，科技的发展與进步又依赖于科技人才。鼓励科技人才的积极性，不能仅停留在精神层面，必须要落实到具体的物质上。