苹果全基因组AHK家族成员鉴定及表达分析

来源 :西南师范大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wenxiaoyao1214
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通过生物信息学分析,将从苹果全基因组中鉴定出的11个组氨酸激酶蛋白基因(MdAHKs)依次命名为MdAHK1~MdAHK11,依据是这些基因在染色体上的位置;此外,对MdAHK1~MdAHK11的理化特性、系统进化关系、蛋白基序及启动子元件进行了分析.MdAHK编码的蛋白大小为901~1230 aa;等电点介于4.95和8.56之间;对蛋白保守基序的分析发现,MdAHKs家族成员中有4~10个保守基序,根据系统进化分析将MdAHKs家族11个成员分为了A1,A2和A3共3个亚家族.此外,利用RT-qPCR
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