目的了解献血人群中艾滋病病毒（HIV）感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化分析技术构建贝叶斯（BI）和最大似然（ML）系统树,确定毒株亚型,并针对亚型地理分布进行统计分析。结果来自全国13个省市的115例HIV阳性献血者标本中,成功扩增并获得pol区基因序列89例,发现HIV-1基因亚型9种,其中,亚型CRF01_AE和CRF07_BC所占比例最高,分别占46.1%（41/89）和37.1%（33/89）;亚型CRF08_BC、B分别占2.2%（2/89）、5.6%（5/89）;其他亚型CRF65_CPX、CRF55₀1B、CRF59₀1B、CRF68₀1B、CRF62_BC各占1.1%（1/89）。系统进化进一步分析显示,所占比例最高的是CRF01_AE中的Cluster 4和Cluster 5亚簇以及CRF07_BC中的msm亚簇,所占比例分别达到23.6%（21/89）、21.3%（19/89）和33.7%（30/89）,这3个均是全国男男性行为者（MSM）传播途径中的主要流行亚簇。结论全国献血途径检测出的HIV-1基因型呈现复杂的多样性特征,尤其在MSM传播HIV感染者中占绝对优势毒株的CRF01_AE（C4和C5簇）和CRF07_BC-msm簇也是本次在献血人群中发现的主要流行毒株。