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利用基因芯片筛选出扩张型心肌病(DCM)中微RNA (miRNA)的差异表达谱,通过生物信息学技术对miRNA靶基因进行预测,构建DCM相关的基因调控网络。
方法收集26例扩张型心肌病患者及相匹配的30例健康者为对照。抽提和纯化血浆RNA,基因芯片扫描,用Real-time PCR验证及定量检测,通过生物信息学技术对miRNA靶基因进行预测,构建DCM相关miRNA-Gene- Network网络。
结果通过基因芯片筛选发现DCM有24个miRNA差异表达,其中15个miRNA表达上调,9个miRNA表达下调。生物信息学分析发现,miR-20a、miR-23a、miR-24这三个miRNA可能在DCM中发挥重要作用;而进一步的Real-time PCR发现在DCM组,miR-20a的表达量与对照组比较无统计学差异(1.29±1.12比1.07±0.74,P=0.557),而miR-23a和miR-24的表达量均高于对照组(2.72±1.45比1.19±1.05; 1.91±1.09比0.954±0.81,均P<0.01),差异有统计学意义。
结论DCM与正常健康者之间存在miRNA差异表达,这些miRNA可能与DCM有关,而miR-23a和miR-24在DCM患者中表达升高,它们可能是DCM的关键miRNA。