论文部分内容阅读
从海量的单核苷酸多态性(SNPs)中,挑选出与疾病或某些临床、环境因素有关的位点,仍是全基因组关联研究中的一个重要课题。针对表型-SNP数据构成的二维列联表结构,提出了一个Logistic SVD模型。该模型可以同时考虑所有的SNP。另外,通过刻画SNP基因型在不同疾病表型水平下的分布差异,基于该模型构建了一个SNP检测准则。模拟研究显示,所提出的检测准则比现有的检测方法更加有效。