陆地棉耐碱基因GHZAT12的克隆、表达及生物信息学分析

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一些锌指蛋白转录因子家族成员在调节植物生长、发育和非生物胁迫中发挥重要作用.本研究旨在了解棉花C2H2转录因子家族中的成员GhZAT12在应对抵御逆境胁迫方面的作用.生物信息学分析结果显示,GhZAT12基因的编码区序列全长为474 bp,编码157个氨基酸,蛋白质分子量为17.074 kD.GhZAT12蛋白不含跨膜结构域,是一种非分泌型亲水蛋白,有7个磷酸化位点,没有信号肽.GhZAT12包含两个C2H2型锌指结构域,在其N端含有保守的L-box,C末端含有一个EAR-Motif.系统发育树分析表明GhZAT12与可可(XP_017982131.1)中的锌指蛋白亲缘关系较近.从棉花中克隆获得GhZAT12基因CDS序列,并构建了亚细胞定位载体,利用烟草瞬时表达系统对GhZAT12-GFP融合蛋白进行了亚细胞定位,结果表明,GhZAT12蛋白定位于细胞核中.qRT-PCR分析结果表明,陆地棉中GhZAT12的相对表达量在根中最高,其次是叶,在茎中表达量最低.碱胁迫处理后不同时间内,GhZAT12基因的表达量先升高后下降,推测GhZAT12基因可能在碱胁迫中发挥着重要的作用.
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