【摘 要】
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对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70%
【机 构】
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浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室浙江师范大学化学与生命科学学院;
【基金项目】
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浙江省自然科学基金项目(LQ16C150001);浙江省农业新品种选育重大科技专项(2016C02052-9);浙江省“重中之重”学科生物学开放基金项目;浙江师范大学博士基金科研项目
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对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70%),三核苷酸次之(21.45%)。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11(Vc SSR19),最小值为1.41(Vc SSR41),平均值为3.90。香农多样性指数变化范围是0.64~2.31,平均值为1.55。观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050~0.900和0.293~0.870,平均值分别为0.457和0.677。使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份。南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质。
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