利用芥菜转录组信息挖掘SSR标记及用于种质分析

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【目的】为开发高效的芥菜Brassicajuncea.分子标记。【方法】本研究通过对芥菜转录组测序的信息搜索SSR位点并分析其分布特点,应用Primer 3.0软件设计SSR引物,随机选择50对引物扩增44份芥菜种质,检测其多态性。【结果】芥菜转录组测序共获得55636条unigene,全部序列有48193376 bp;有7834条unigene包含SSR的序列,从中鉴定出9526个SSR位点,其中有1371条序列包含1个以上SSR,复合SSR有572个,SSR发生频率为14.08%。优势重复基序为三核苷
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