【摘 要】
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采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分
【机 构】
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新疆畜牧科学院兽医研究所,新疆 乌鲁木齐,830013;巴音郭楞职业技术学院,新疆 库尔勒,841000;新疆维吾尔自治区动物卫生监督所,新疆 乌鲁木齐,830013
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采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2031 bp,存在ORF V1(41～994 nt)、ORF C1(1166～1981 nt)、ORF C2(410～790 nt)、ORF C3(2～292 nt)和ORF C4(739～984 nt)5个阅读框,5′端和3′端基因间隔区长度分别为90 nt和171 nt.XJ1与已报道的24株鸽圆环病毒全基因组序列同源性为87.2％～94.9％,其中与GF17和GH1834的同源性最高(均为94.9％),基于基因遗传进化树显示,XJ1株与Cap蛋白起始密码子“ATG”分支中GF82、JF007及GH1834亲缘关系最近.鸽圆环病毒新疆株全基因组序列的分析为疫苗开发提供资料参考.
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