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采集甘蔗梢腐病发病植株叶片为材料，采用组织分离法，分别取发病甘蔗叶片和叶片的病健交接处，用PDA培养基对甘蔗梢腐病病原菌进行分离和纯化，将纯化后的菌株进行形态学和显微镜观察，采用CTAB法提取菌丝DNA，利用2对真菌ITS通用引物进行PCR扩增，琼脂糖凝胶电泳后，回收特异条带，T克隆测序。结果表明，甘蔗梢腐病原菌ITS序列与镰刀菌属ITS序列高度同源，属于镰刀菌属。