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文章建立了一种约束优化的演化模型，并构造出求解此模型的多种群空间收缩遗传算法，将信息熵概念引入进化过程，控制各种群寻优搜索时解空间的收缩。该算法用种群的多样性避免遗传进化的早熟现象，并以空间收缩尺度作为停机判椐，有效地控制了算法的收敛。利用基于小种群的多种群进化策略，在保证种群多样性的前提下，极大程度地减少了计算量，提高了计算效率。数值算例表明，熵的介入增强了随机搜索类进化算法的寻优目的性，使收敛过程平稳且迅速。算例表明此算法能有效的应用于药物分子对接设计。