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丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌是一类能与高等植物形成菌根的古老共生真菌,由于AM真菌不能纯培养,因此通过传统形态学方法研究存在局限性和不稳定性。近年来,分子生物学方法已被广泛应用于AM真菌多样性的研究。从研究材料选择、DNA的提取、AM真菌特异性引物、分子生物学方法方面综述了分子生物学技术在AM真菌多样性研究中的一般过程以及重要应用,并展望了应用前景。