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很久以来,微生物学的作用就和矿业活动联系在一起了,并多方面的参与了采矿的经济活动。最初,有色金属矿和煤矿的开采者们常常面临因含铁酸性水腐蚀作用造成的地下采矿设备保养困难,及由于含重金属废水排放到自然环境中所造成的污染,并承受其后果。后来仅仅是在近代,1948年人们才认识到在西班牙Huelva省采出的黄铁矿矿石中存在活的有机质及其在工业发展中应用的全部可能性。