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人类基因组中存在“头对头”方式的基因对，两个基因5’端相邻并分别位于DNA的正负两条链上，其转录起始位点之间的距离不大于1000bp。一般认为“头对头”基因对可能共享同一个启动子，即“双向启动子”。通过鉴定出1190对“头对头”基因对，表达相似性结果显示比随机情况更倾向于共表达。“头对头”基因对的遗传调控位点研究显示，SNPs对“头对头”基因对存在不同的调控模式，有助于进一步理解双向启动子的调控机制，为进一步了解人类基因转录调控机制提供帮助。