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以普通型苹果品种‘富士'和柱型苹果‘舞姿'以及其杂交后代的柱型与非柱型实生苗为试材,建立了苹果的ISSR(Inter-Simple Squence Repeat polymorphic DNA)分子标记体系,并将ISSR标记用于苹果柱型基因Co的遗传分析.结果表明,在20 μL反应体系中各组分的用量为Taq DNA聚合酶1U、Mg2+的浓度为2.5 mmol*L-1、模板DNA用量20 ng、引物浓度0.2 μmol*L-1及退火温度52℃,80%引物具有良好的扩增能力.调整模板DNA的用