【摘 要】
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基于基因组序列信息,研究了二倍体森林草莓和八倍体栽培草莓染色体上SSR位点的分布特点.利用AutoSSR软件在森林草莓和栽培草莓中分别发掘到153 826个和329 801个SSR位点,发生
【机 构】
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浙江省农业科学院园艺研究所,杭州,310021
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基于基因组序列信息,研究了二倍体森林草莓和八倍体栽培草莓染色体上SSR位点的分布特点.利用AutoSSR软件在森林草莓和栽培草莓中分别发掘到153 826个和329 801个SSR位点,发生频率分别为1.43 kb/SSR和2.44 kb/SSR.SSR重复基序为单核苷酸的数量最多,分别占总数的40.92％和38.94％,其次为二核苷酸类型,分别占22.79％和20.04％.在二倍体草莓和八倍体草莓中分别鉴定到454和479种SSR重复类型,其中A/T重复类型的SSR出现的频率最高,分别占总SSR位点的39.45％和37.08％.二核苷酸重复类型中,二倍体草莓的AT/AT占比最高,为11.61％,其次为AG/CT(8.74％);八倍体草莓中AG/CT重复类型占比最高(9.94％),其次为AT/AT(7.35％).用Beacon Designer软件设计SSR引物,随机挑选了59对SSR引物在77份草莓材料中进行验证分析.研究结果显示,59对SSR引物共扩增出254个多态性位点,平均扩增4.31个位点,位点的平均多态信息量(PIC)为0.26,介于0.07～0.97之间,其中35个SSR位点PIC≥0.50,为高多态性位点,聚类分析显示品种间的相似系数范围为0.47～0.99.该研究为草莓种质资源的遗传多样性评价、变异分析、分子标记辅助育种等工作提供了技术支持.
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